CloneAssist - BÊTA

CloneAssist est conçu pour aider les biologistes moléculaires à étendre leurs capacités de flux de travail grâce à des analyses de séquences, des annotations, un suivi et des rapports.

eLabNext recherche des utilisateurs intéressés à devenir des bêta-testeurs de ce module complémentaire afin de recueillir des commentaires sur les améliorations des fonctionnalités. En tant que bêta-testeurs, les utilisateurs bénéficieront d'un essai gratuit prolongé d'un an de CloneAssist. À sa sortie complète, CloneAssist sera proposé en tant que module complémentaire payant.

Principales fonctionnalités de CloneAssist - Présentation

1). Intégration parfaite à eLabNext

• Le fichier est enregistré dans une section CloneAssist et un aperçu de CloneAssist est affiché lorsque l'utilisateur n'y travaille pas.
• Les utilisateurs peuvent désormais créer une section CloneAssist dans le cadre d'une expérience.

2). Visualisation des plasmides

• Le fichier de données est maintenant visualisé sous forme de plasmide. Cela montre toutes les fonctionnalités, les amorces, les cadres de lecture ouverts et les enzymes de restriction, ce qui permet de visualiser facilement les parties les plus pertinentes pour votre recherche.

3). Electrophorèse sur gel

• En découpant votre séquence avec des enzymes de restriction, les utilisateurs obtiennent différents fragments qui sont souvent vérifiés par électrophorèse sur gel.
• CloneAssist fournit une visualisation de l'électrophorèse sur gel avec différents marqueurs.
• Le gel peut présenter une ou plusieurs réactions multiples en une seule vue.

4). Coupez facilement des molécules avec certaines enzymes de restriction, puis appliquez les résultats à de nouvelles molécules

• Lorsqu'ils ajoutent une ou plusieurs enzymes de restriction à votre tube, les utilisateurs peuvent voir directement combien de coupes l'enzyme de restriction effectuera dans la ou les molécules.
• Les résultats montrent tous les fragments issus de la réaction de coupe.

5). Visualisez à la fois les séquences linéaire et circulaire

• Lorsque vous effectuez une sélection ou sélectionnez une caractéristique qui vous intéresse, les vues sont synchronisées.

6). Ajouter des fonctionnalités personnalisées

• Ajoutez vos fonctionnalités personnalisées dans la séquence en passant la souris sur la fin de votre sélection et en cliquant sur « + Fonctionnalité ».

7). Travaillez sur plusieurs réactions en même temps

• Plusieurs tubes peuvent être créés pour effectuer une réaction. Ils peuvent être ouverts simultanément ou repliés pour une utilisation ultérieure.

8). Plusieurs options d'import/export

• Lorsque vous démarrez une nouvelle section CloneAssist, vous pouvez importer des données depuis différents formats tels que snapgene (.dna), GenBank (.gb), CloneManager (.cm5) et fasta (.fasta).
• Les molécules peuvent être exportées sous forme d'image (.png).

9). Filtrez les éléments en fonction des besoins de votre laboratoire

• Les visualisations sont conçues pour répondre aux besoins des utilisateurs. Par exemple : si l'utilisateur ne s'intéresse qu'aux enzymes de restriction capables de couper la molécule, il peut désactiver toutes les autres options de visualisation.
• Il est également possible de n'afficher/masquer que des fonctionnalités spécifiques.

10). La visualisation des séquences montre, de manière très détaillée, comment le brin ADN/ARN est construit

• La vue linéaire fournit des informations plus détaillées, telles que la séquence réelle.
• Lorsqu'ils survolent une enzyme, les utilisateurs peuvent voir les sites de découpe.